Het Kenniscentrum werkt al lange tijd samen met het Erasmus MC en het UMCU. Zij leveren een grote inhoudelijke bijdrage en vaardigen topexperts af aan de wetenschappelijke raad, de expertraden en de expertgroepen. Andere academische partners:

• Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG)
• Universiteit van Amsterdam (UvA)
• Vrije Universiteit (VU)

• Altrecht: algemene ggz-instelling
• De Banjaard: jeugd-ggz-insteling
• Brijder jeugd: verslavingshulp (12-23 jaar)
• Daimh: infant mental health
• Haags Kinder- en Jeugdtherapeuticum: trauma bij kinderen en jongeren
• HSK Groep: algemene ggz-instelling gespecialiseerd in psychische zorg voor werknemers
• Leo Kannerhuis: autisme bij kinderen en jongeren
• Mutsaersstichting: zorg- en onderwijsondersteuning, begeleiding en behandeling van kwetsbare doelgroepen
• Nederlands Instituut voor Forensische Psychiatrie en Psychologie (NIFP): Medisch en Zorgconcern
• Orbis Medisch en Zorgconcern: levenslange medische en geestelijke gezondheidszorg
• Trajectum: ggz-instelling voor LVB
• VNN, Verslavingszorg Noord Nederland: verslavingszorg
• De Waag: grensoverschrijdend gedrag gecombineerd met een psychische stoornis